Puma 2019

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Paarweise Schätzungen von ¦ st wurden auf den verschiedenen räumlichen Puma 2019 Skalen durchgeführt, die in diesen Szenarien getestet wurden, und halfen bei der Beurteilung der Unterscheidungskraft von Einheiten sowohl großer als auch regionaler Populationen (Tabellen S4 und S5) auf die historischen Demografie-Pumas, wie sie von der mtDNA enthüllt wurden. In der ersten Analyserunde haben wir unter Verwendung von fünf Personen mit den unterschiedlichsten Haplotypen und zwei Jaguarundis die Substitutionsrate des analysierten ND5-Segments auf 2,054% pro Million Jahre (MY) geschätzt. Unter Verwendung dieser Substitutionsrate in der zweiten Reihe von Analysen ermittelten wir einen mittleren t MRCA von 0,237 MYA (95% HPD: 0,105 0,391 MYA).

Für südamerikanische Puma wurde der mittlere t MRCA auf 0,211 (0,091 0,353) MYA geschätzt. Wenn nordamerikanische (NA) und zentralamerikanische (CA) Proben getrennt analysiert wurden, betrug ihre mittlere geschätzte t MRCA 0,231 (0,102 0,387) MYA. Schließlich schätzten wir die t MRCA für eine Untergruppe von 24 NA CA-Proben, Puma Basket Platform die einen endemischen monophyletischen Cluster bildeten (siehe Abbildung 2A), und ergaben einen Wert von 0,037 (0,006 0,077) MYA (vor ca. 8.000 Jahren) demografische Expansion bei Pumas (Abbildung 4). Das Signal für diese Erweiterung war bei beiden Datensätzen (nur Vollstichprobe und südamerikanische Pumas) mit nur geringen Unterschieden bei den geschätzten Puma Bmw Parametern erkennbar.

Bayesian Skyline-Diagramme, die aus einem Alignment von Puma-ND5-Sequenzen abgeleitet wurden. In (A) wurde die Analyse für alle Puma-Proben und in (B) nur für südamerikanische Puma durchgeführt. Die dicke durchgezogene Linie stellt den Mittelwert dar, während die 95% -HPD-Grenzen (höchste hintere Dichte) durch die blauen Bereiche angezeigt werden. Die vertikalen gestrichelten Linien beziehen sich auf die t MRCA, wobei die dünne Linie die untere 95% -HPD-Grenze angibt und die dicke Linie den Mittelwert darstellt. Die x-Achse ist auf einer Jahrmillionenskala (Myr) dargestellt. Die y-Achse repräsentiert die effektive Populationsgröße (N e) multipliziert mit der Generationszeit (auch in myr).

Unter der Puma Creepers Annahme einer Generationszeit von 5 Jahren sollten die Zahlen auf dieser Achse mit 200.000 multipliziert werden, um interpretierbare Werte zu erhalten. Der in dieser Studie analysierte mtDNA-Datensatz ermöglichte ein tieferes Verständnis der matrilinealen Vorgeschichte von Puma, Verfeinerung, Erweiterung und in einigen Fällen Anpassung die zuvor von Culver et al. (2000). Unsere erste Beobachtung war, dass ND5 in der Tat ein sehr informatives codierendes mtDNA-Segment für phylogeographische Studien von Feliden ist und dass das hier verwendete längere Segment (im Vergleich zu dem von Culver et al., 2000) nützliche zusätzliche Informationen zu dieser Art liefert. Vielfalt und Evolutionsgeschichte.

Beim Vergleich subkontinentaler oder regionaler Pumagruppen stellten wir fest, dass die Haplotyp- und Nucleotid-Diversitätsindizes für Süd- und Mittelamerika im Vergleich zu den für Nordamerika geschätzten konstant höher waren (Tabelle 2). Die Gendiversität war in Südamerika am höchsten, während die Nukleotiddiversität in Mittelamerika ein Maximum erreichte. Nordamerikanische Pumas wiesen für beide Indizes niedrige Werte auf, die mindestens doppelt so niedrig waren wie jene der anderen subkontinentalen Gruppen. Bei der Bewertung der von der AMOVA definierten südamerikanischen Regionalgruppen (Definition siehe Abbildung 1 und Tabelle 3) stellten wir fest, dass die CNESA- und CSSA-Gruppen die höchste Haplotypendiversität aufwiesen, wobei auch die SWSA- und Puma Damen NSA-Gruppen hohe Werte aufwiesen (Tabelle 3) 2).

Wenn dies tatsächlich der Fall wäre, wären unsere Ergebnisse in der Tat eine Unterschätzung der Unterscheidung zwischen SCA und NA NCA, da der Haplotyp H24 nur in ersterem natürlich vorkommt. Mittelamerika und Nordsüdamerika (NSA) teilten keine Haplotypen, was impliziert Kein Hinweis auf einen historischen matrilinearen Genfluss zwischen diesen Regionen. Mögliche Hindernisse sind die nördlichste Andenkordillere oder die Darien-Straße in Panama, wie von Eizirik et al. Für Jaguare vorgeschlagen. (2001) (siehe jedoch Ruiz-Garcia et al., 2013 für eine andere Ansicht). Eine detaillierte Stichprobe in dieser

Region wäre erforderlich, um zwischen diesen beiden Hypothesen zu unterscheiden.

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